2012年至2021年，海门抢抓多重叠加的发展机遇，始终不渝抓发展，一着不让抓转型，推动一二三产联动发展，促进经济结构不断优化。2012年，海门第一产业增加值46.5亿元，第二产业增加值377.6亿元，第三产业增加值239亿元，三次产业结构比为7：57：36；到2021年，海门三次产业占比发生重大变化，三产比重大幅度增加，第一产业增加值72.64亿元，第二产业增加值769.69亿元，第三产业增加值727亿元，三次产业结构比调整为4.6：49.1：46.3。
第一产业作为基础产业，结构在调优。尤其是近年来，海门大力推进乡村振兴，农业现代化水平持续位居全省第一方阵，2021年高标准农田比重达75%，家庭农场达3130个，农民专业合作社达587个。全区设施农业面积总量达20057公顷，全年粮食总产量25.18万吨，比2012年的18.43万吨增长了36.63%。2021年年末农业机械总动力43.6万千瓦，比2012年年末拥有农业机械总动力33.52万千瓦增长了30.07%。
第二产业作为支撑产业，结构不断优化，发展质效不断提升，产业规模不断扩大。到2021年全区已经形成了三个千亿级产业，大健康产业、新一代信息技术产业、金属新材料等新兴产业快速崛起。重大项目建设从招商局重工的百亿级项目到中天绿色精品钢的千亿级项目，实现了历史性突破。尤其是近五年来，海门累计开工超10亿元产业项目100个，战略性新兴产业产值占规上工业比重达40%。市场主体总数五年净增1万家，高新技术企业数量增长1.6倍，省级重点实验室、省级公共技术平台、国家级企业技术中心、国家级科学技术奖励相继实现突破。入选省“双创”人才数连续四年位列南通第一。
第三产业是区域经济转型升级的标准。十年来，海门抓住新型城镇化建设的契机，大力发展城镇经济，推进生产性服务与生活性服务联动发展，新业态不断涌现。2012年海门拥有重点服务业企业89家，2021年海门一年增加规上服务业企业就达到70家。2012年重点服务业企业一年完成经营收入152.21亿元，2021年全区服务业应税销售达到673.23亿元，营利性服务业营业收入较上年增长52%。益诺思获评省生产性服务业优秀机构，南通唯一。叠石桥市场获评全国商品交易双循环示范市场，线上线下成交额达1350亿元。科技金融、信息技术、总部经济等楼宇项目加快集聚，新增纳税超亿元楼宇两幢。
